Johannes Watzel wurde 1970 in Berlin geboren. Er war zunächst Schüler von Madelaine Caruzzo in Berlin, später von Gorjan Kosuta an der Hochschule für Musik in Köln und von Thomas Brandis an der Universität der Künste Berlin. In Köln erhielt er Kammermusikunterricht bei den Mitgliedern des Amadeus-Quartetts sowie des Alban Berg Quartetts. Seit 1997 ist er Mitglied des Deutschen Symphonie-Orchesters Berlin als Stellvertretender Stimmführer der Zweiten Violinen.